遺伝子シーケンシング：市場シェア分析、業界動向と統計、成長予測（2026年～2031年）

Mordor Intelligenceによると、遺伝子シーケンシング市場の規模は、2025年に69億4,000万米ドル、2026年に78億2,000万米ドルとなり、2031年までに141億7,000万米ドルに達すると予測されており、2026年から2031年にかけてCAGR12.64％で成長すると見込まれています。

本レポートは、技術タイプ（次世代シーケンシング、サンガー法など）、製品（シーケンシング装置、消耗品など）、用途（臨床診断など）、エンドユーザー（病院・診断検査機関など）、地域（北米、欧州、アジア太平洋など）ごとに分類されています。市場予測は金額（米ドル）ベースで提示されています。

世界の遺伝子シーケンシング市場の動向と洞察

精密腫瘍学パネルの臨床現場での採用拡大

包括的なゲノムプロファイリングには、対象となる患者層への浸透余地が依然として残されているため、臨床腫瘍学は遺伝子シーケンシング市場において最も強力な需要の原動力であり続けています。米国メディケア・メディケイドサービスセンター（CMS）は、次世代シーケンシング検査がコンパニオン診断としてFDAの承認または認可を受けている場合、進行がん患者に対してNCD 90.2を通じて償還の基盤を提供し続けており、この枠組みが検証済みのプラットフォームへの検査室の投資を支えています。また、同遺伝子シーケンシング市場は、微小残存病変（MRD）および分子残存病変（MRD）のモニタリングからも後押しを受けています。この分野では、液体生検検査の繰り返し実施により、従来のPCRワークフローに代わる高感度シーケンシングの必要性が高まっています。この傾向は重要な意味を持ちます。なぜなら、連続的な検査は単発の診断イベントではなく、継続的な検査量を創出するため、導入済みの機器の利用率を向上させるからです。より多くの標的療法がコンパニオン診断のサポートを必要とするにつれ、シーケンシング能力を持たない検査室は競合力が低下し、臨床的意義を持つことが難しくなります。これが、遺伝子シーケンシング市場が検査件数を増やしているだけでなく、日常的な治療選択のプロセスにますます組み込まれつつある理由です。

塩基あたりのシーケンシングコストの低下とスループットの向上

遺伝子シーケンシング市場は、ベンダー各社がスループットの向上と消耗品費の削減を商用ワークフローに組み込むことで、コストの急速な再設定の恩恵を受けています。PacBio社は2026年、同社のSPRQ-Nx化学技術とSMRTセルの再利用を組み合わせることで、サンプルあたり300米ドル未満で大規模なHiFi全ゲノムシーケンシングが可能になったと発表しました。これにより、ロングリードシーケンシングは、より広範な臨床プログラムが対応可能な予算水準に近づいています。イルミナも2026年2月、既存のNovaSeq Xインフラ上で、消耗品費と解析費を合わせて1サンプルあたり395米ドルの「TruPath Genome」を発売しました。これにより、研究所は長距離ゲノム解析を行うために新しい装置を購入する必要がなくなり、導入のハードルが低くなりました。こうした動きは購買行動に変化をもたらしています。サンプルあたりのコストが低下したことで、装置の定価そのものよりも、検査量やワークフローの適合性がより重要になっているからです。遺伝子シーケンシング市場において、この変化は、試薬価格のみではなく、ソフトウェア、アッセイ設計、データ解釈、品質保証を通じて顧客を維持できるベンダーに有利に働きます。また、これは、生のシーケンシング性能が競争力がある場合でも、ワークフローの統合力が弱いプラットフォームは苦戦を強いられる可能性があることを意味します。

シーケンサーと自動化システムの高い資本集約性

遺伝子シーケンシング市場は、診断分野において依然として最も高い資本参入障壁の一つを抱えています。これは、ハイスループット機器には多額の初期投資が必要であり、検査室が十分な利益率を確保できるようになるまでに数年にわたる減価償却期間を要するためです。多くの地域病院や地方の検査室にとって、リースオプション、シェアードサービスモデル、あるいは処理量のコミットメントがなければ、ハイエンドシステムの導入を正当化することは依然として困難です。この問題はシーケンサーだけにとどまりません。臨床規模での運用には、液体ハンドリング、自動化されたライブラリ調製、そして安全な情報インフラも必要となるからです。試薬コストの低下は助けにはなりますが、安定した検体フローがない検査室における機器の稼働率低下の負担を取り除くものではありません。これにより、遺伝子シーケンシング市場には二極化が生じています。資金力のある学術機関や参照検査室は、より多くの検体数でコストを分散させることができますが、小規模なプロバイダーは採算の取れるビジネスモデルを構築するのに苦労しています。また、多くの低・中所得国市場では、現地のシーケンシング能力を拡大する前に、リスクの低い導入モデルが必要であるため、地理的な拡大が遅れています。

セグメント分析

2025年、次世代シーケンシングは遺伝子シーケンシング市場シェアの68.57％を占めました。これは、長年にわたる臨床的検証、充実した試薬エコシステム、そして学術機関や参照検査室における大規模な導入実績を反映したものです。顧客はすでに、ショートリードプラットフォームに紐づいた検証済みのワークフロー、訓練を受けたチーム、調達関係を有しているため、この主導的地位を覆すことは依然として困難です。サンガーシーケンシングは、確認作業において、規模は小さいながらも確固たる役割を維持しています。特に、検査室が次世代シーケンシングの完全なワークフローを実行することなく、低スループットの検証を必要とする場合にその価値が発揮されます。これにより、大量シーケンシングが幅広いパネル、エクソーム、ゲノム解析へと移行する中でも、従来の方法には実用的な位置づけが保たれています。したがって、現在の遺伝子シーケンシング市場は依然として次世代シーケンシングが中核を成していますが、ロングリードシステムのコスト面やワークフローの整備が進むにつれ、その独占的な地位は薄れつつあります。

第3世代シーケンシングは、2031年までCAGR12.96％で拡大すると予測されており、遺伝子シーケンシング市場において最も急成長している技術カテゴリーとなる見込みです。需要が高まっている背景には、構造変異の検出、フェーズ付きゲノムアセンブリ、メチル化解析、反復領域の解明といった分野において、ネイティブのロングリードが、ショートリード法では完全には実現できない付加価値をもたらすためです。PacBio社は2026年、SPRQ-Nx化学技術によりSMRTセルの再利用が可能となり、サンプルあたり300米ドル未満で大規模なHiFi全ゲノムシーケンシングをサポートできると発表しました。これは、プログラムのより広範な導入に向けた重要なコスト面でのハードルとなります。イルミナ社の「TruPath Genome」もまた、ショートリードの既存企業が、その需要をロングリードの専門企業に譲り渡すのではなく、既存のハードウェアに長距離解析機能を追加することで顧客を維持しようとしていることを示しています。2031年までには、困難なバリアントの解明を必要とする研究所がロングリード機能の導入や追加を行う理由がより強まるため、遺伝子シーケンシング市場における技術構成は、これほど一方的ではなくなる可能性があります。

2025年には、消耗品が売上高の52.79％を占めており、これは遺伝子シーケンシング市場が、1回限りの資本財販売よりも、継続的な購入にどれほど強く依存しているかを示しています。フローセル、試薬キット、ライブラリ調製製品は、実行のたびに購入されるため、装置の導入ペースが鈍化しても、スループットが向上すれば売上高は増加します。この傾向により、既存ベンダーはより安定した基盤を確保できます。稼働中の各機器が、数年間にわたり消耗品の需要を継続的に生み出す源となるからです。また、プラットフォームの顧客を失うことは単一の製品販売ではなく、継続的な収益源に影響を与えるため、新規顧客の獲得と同様に既存顧客の維持も重要となります。したがって、遺伝子シーケンシング業界は、最大の製品基盤を守るために、導入済み機器の耐久性、ワークフローの利便性、およびアッセイの一貫性に依存しています。

遺伝子シーケンシング市場におけるシーケンシング装置の市場規模は、2026年から2031年にかけてCAGR13.52％で拡大すると予測されています。これは、各研究所が旧式のベンチトップシステムをアップグレードし、臨床パネル、エクソーム、全ゲノム解析向けに高スループットなプラットフォームを追加するためです。また、検査を分散型臨床現場に近づける必要性も、装置需要を支えています。こうした現場では、ターンアラウンドタイムや検体管理がより重要視されるためです。とはいえ、機器の買い替えサイクルは数年単位に及ぶ一方で、検査実行数はより継続的に増加する可能性があるため、長期的な収益構成は消耗品にさらに偏っていくと見られます。これが、ベンダー各社が、単に機器の設置数に頼るのではなく、新機種の発売に合わせて、導入済みシステムの価値を高める化学試薬、ソフトウェア、自動化の改良を組み合わせている理由の一つです。遺伝子シーケンシング市場において、機器は入り口を開く役割を果たしますが、収益モデルの持続可能性を決定づけるのは依然として消耗品なのです。

地域別分析

2025年、北米は遺伝子シーケンシング市場シェアの41.37％を占め、引き続き最大の地域貢献者となりました。米国では、CMS NCD 90.2が進行がん患者向けの承認または認可された次世代シーケンシングコンパニオン診断を支援しているため、腫瘍学分野におけるより強固な償還基盤の恩恵を受け続けています。この償還構造は、がんセンター、病院検査室、およびリファレンスネットワーク全体における、検証済みの臨床シーケンシングワークフローへの投資を支えています。また、フロリダ州のメディケイド・プログラムも2025年に、迅速全ゲノムシーケンシングに対する1検査あたり2,716.9米ドルの償還を開始しました。これは、臨床的な全ゲノムシーケンシングが州レベルで新生児や小児の希少疾患の使用事例へと拡大していることを示しています。カナダとメキシコは同地域内では依然として貢献度が小さいもの、費用のハードルが低く、希少疾患へのアクセスが広いため、米国以外の地域においても遺伝子シーケンシング市場の拡大に寄与しています。

2025年、欧州は依然として第2位の地域ブロックであり、ドイツ、英国、フランスが同地域の収益の大部分を占めています。英国では、「Genomics England」および「NHS Genomic Medicine Service」を通じて実用的な基盤が整備されており、これにより、希少疾患やがん治療における全ゲノムシーケンシングの導入経路がより明確になっています。また、ドイツの法定健康保険制度も、腫瘍学分野における包括的なゲノムプロファイリングへの支援を強化しており、これによりシーケンシングが学術研究機関の枠を超えてさらに普及しつつあります。ただし、同地域の成長は依然として、GDPRに基づくデータ居住要件や転送要件によって抑制されており、これらはインフラコストを押し上げ、小規模な研究所が大規模なベンダーと同等の運営の堅牢性を確保することを困難にしています。

アジア太平洋地域は、2031年までCAGR14.53％で拡大すると予測されており、遺伝子シーケンシング市場において最も成長の速い地域となる見込みです。中国における競合環境は、国内プラットフォームの積極的なポジショニングと、外国企業によるゲノムデータへの参入に対する規制強化によって再編されつつあります。MGI Techは2026年3月、STOmicsおよびCycloneSEQの買収を発表し、これによりショートリードシーケンシング、ロングリードナノポアシーケンシング、空間オミクスを単一のポートフォリオの下で網羅する体制を拡充しました。韓国もロングリードおよびリファレンスゲノムに関する能力を強化しており、一方、インドのゲノムマッピングへの取り組みは、今後数年にわたり機器や消耗品に対する持続的な需要を支えています。中東・アフリカおよび南米は依然として初期段階にありますが、GCC市場におけるゲノムインフラへの投資や、ブラジルでの臨床シーケンシングネットワークの拡大により、遺伝子シーケンシング市場への明確な参入機会が生まれています。

その他の特典：

• エクセル形式の市場予測（ME）シート
• 3ヶ月間のアナリストによるサポート

よくあるご質問

• 遺伝子シーケンシング市場の規模はどのように予測されていますか？
  • 2025年に69億4,000万米ドル、2026年に78億2,000万米ドル、2031年までに141億7,000万米ドルに達すると予測されています。CAGRは12.64%です。
• 遺伝子シーケンシング市場の主要な技術タイプは何ですか？
  • 次世代シーケンシング、サンガー法、第3世代シーケンシングなどです。
• 遺伝子シーケンシング市場の主要な製品は何ですか？
  • シーケンシング装置、消耗品などです。
• 遺伝子シーケンシング市場の主要な用途は何ですか？
  • 臨床診断などです。
• 遺伝子シーケンシング市場の主要なエンドユーザーは誰ですか？
  • 病院・診断検査機関などです。
• 遺伝子シーケンシング市場の地域別シェアはどうなっていますか？
  • 2025年、北米が41.37%、欧州が第2位、アジア太平洋が最も成長する地域と予測されています。
• 遺伝子シーケンシング市場における主要企業はどこですか？
  • Illumina, Inc.、Pacific Biosciences of California, Inc.、Thermo Fisher Scientific Inc.などです。
• 遺伝子シーケンシング市場の成長を促進する要因は何ですか？
  • 精密腫瘍学パネルの臨床現場での採用拡大、塩基あたりのシーケンシングコストの低下、スループットの向上などです。
• 遺伝子シーケンシング市場の成長を抑制する要因は何ですか？
  • シーケンサーおよび自動化設備の高い資本集約度、データガバナンスの制約などです。

目次

第1章 イントロダクション

• 調査の前提条件と市場の定義
• 調査範囲

第2章 調査手法

第3章 エグゼクティブサマリー

第4章 市場情勢

• 市場概要
• 市場促進要因
  • 精密腫瘍学パネルの臨床現場での採用拡大
  • 希少疾患および未診断疾患に関するプログラムの拡大
  • 塩基1つあたりのシーケンシングコストの低下とスループットの向上
  • 人口規模のゲノム解析とバイオバンクの拡大
  • 構造変異の発見におけるロングリードシーケンシングへの移行
  • 分散型かつ患者に近いワークフローにおけるシーケンシングの利用拡大
• 市場抑制要因
  • シーケンサーおよび自動化設備の高い資本集約度
  • 市場ごとの臨床シーケンシングに対する償還額のばらつき
  • データガバナンス、プライバシー、および国境を越えたゲノムデータの制約
  • バイオインフォマティクスおよび臨床解釈の分野における熟練人材の不足
• 価値およびサプライチェーン分析
• 規制情勢
• 技術展望
• ポーターのファイブフォース分析

第5章 市場規模と成長予測

• 技術タイプ別
  • 次世代シーケンシング（NGS）
  • サンガーシーケンシング
  • 第3世代シーケンシング
  • その他
• 製品別
  • シーケンシング装置
  • 消耗品
  • その他
• 用途別
  • 臨床診断
  • 研究・学術用途
  • ドラッグディスカバリー・開発
  • 集団ゲノミクス
  • その他
• エンドユーザー別
  • 病院・診断検査室
  • 製薬・バイオテクノロジー企業
  • 学術研究機関
  • その他
• 地域別
  • 北米
    • 米国
    • カナダ
    • メキシコ
  • 欧州
    • ドイツ
    • 英国
    • フランス
    • イタリア
    • スペイン
    • その他の欧州諸国
  • アジア太平洋
    • 中国
    • インド
    • 日本
    • オーストラリア
    • 韓国
    • その他のアジア太平洋諸国
  • 中東・アフリカ
    • GCC
    • 南アフリカ
    • その他の中東・アフリカ諸国
  • 南米
    • ブラジル
    • アルゼンチン
    • その他の南米諸国

第6章 競合情勢

• 市場集中度
• 市場シェア分析
• 企業プロファイル
  • 10x Genomics, Inc.
  • Agilent Technologies, Inc.
  • Becton, Dickinson and Company
  • BGI Group
  • Bio-Rad Laboratories, Inc.
  • Danaher Corporation
  • Eurofins Scientific SE
  • F. Hoffmann-La Roche Ltd.
  • Guardant Health, Inc.
  • Illumina, Inc.
  • Invitae Corporation
  • MGI Tech Co., Ltd.
  • Myriad Genetics, Inc.
  • Natera, Inc.
  • Novogene Co., Ltd.
  • Oxford Nanopore Technologies plc
  • Pacific Biosciences of California, Inc.
  • PerkinElmer, Inc.
  • QIAGEN N.V.
  • Thermo Fisher Scientific Inc.

第7章 市場機会と将来の展望